Die Projekte des Sonderforschungsbereichs 894 unterteilen sich in den Bereich A „Von molekularen Mechanismen zur integrativen Funktion“ und den Bereich P „Plattformprojekte“.

Daneben sind die Projekte in themenbezogenen Blöcken, z.B. Immunologie oder synaptische Transmission, angeordnet. Der SFB 894 deckt damit das gesamte Spektrum an Ca²⁺ Signalen von Elementarmechanismen bis zur Körperfunktion ab.